Predstavniki nevladnih organizacij pozivajo vlado, naj ukine funkcijo državnega sekretarja za nacionalni jedrski program. V razpravi o JEK 2 pogrešajo več transparentnosti in želijo premislek o alternativah za energetsko prihodnost. Menijo, da bi javnost morala imeti dovolj informacij o projektu, preden se ga izvede. Kljub temu pa sami ne navajajo nobene resne alternative za stabilno energetsko oskrbo države.